NAGASAKI, 1633: L'INDOMITO PADRE GESUITA CRISTOVAO FERREIRA, CHE DA ANNI SI BATTE IN GIAPPONE PER DIFFONDERE IL CRISTIANESIMO, HA RINNEGATO LA VERA FEDE ED E' DIVENTATO UN APOSTATA: QUESTA E' LA NOTIZIA SCONVOLGENTE CHE GIUNGE A ROMA. LA COMPAGNIA DEL GESU' DECIDE ALLORA DI INVIARE IN ORIENTE DUE GIOVANI FRATELLI, SEBASTIAN RODRIGUES E FRANCISCO GARRPE PER COMPIERE UN'INDAGINE ALL'INTERNO DELLA CHIESA LOCALE. I DUE GESUITI PERO', PARTITI PIENI DI IDEALI E DI ENTUSIASMO, SI SCONTRANO BEN PRESTO CON LA DURA REALTA' DEL GIAPPONE DEI TOKUGAWA E DELLE PERSECUZIONI. I SOSPETTI CRISTIANI VENGONO COSTRETTI DALLE AUTORITA' GIAPPONESI A CALPESTARE IMMAGINI SACRE: CHI SI RIFIUTA VIENE TORTURATO E UCCISO, MENTRE CHI ACCETTA VIENE DERISO E COSTRETTO A VIVERE AI MARGINI DELLA SOCIETA', RIFIUTATO TANTO DALLA COMUNITA' CRISTIANA QUANTO DAI GIAPPONESI. LA VITA IN GIAPPONE SI FA SEMPRE PIU' DIFFICILE PER RODRIGUES CHE ORA VIVE IN PRIMA PERSONA LE PERSECUZIONI E CHE FINISCE, EVANGELICAMENTE, PER ESSERE TRADITO DALL'AMICO KICHIJIRO, IL SUO "GIUDA", MENTRE IMPLORA DIO DI ROMPERE IL SUO "SILENZIO".